病原与宿主互作

产品介绍
小RNA（Small RNA）测序是指通过实验方法富集某一物种或某一组织在特定时空状态下18-30nt的small RNA片段，结合高通量测序平台对这一片段长度的小RNA进行检测分析。小RNA测序可分析miRNA、siRNA、piRNA等。

技术流程
总RNA提取---->小RNA富集---->反转合成cDNA---->文库构建---->上机测序---->生信分析

分析内容
标准信息分析
1. 数据产出统计，对原始信息采集数据去接头污染，去低质量reads
2. small RNA 信息采集结果的长度分布
3. small RNA在选定的参考基因组上的分布
4. small RNA分类统计
5. miRNA定量分析
6. miRNA差异表达分析
7. miRNA表达/差异表达聚类分析
8. miRNA靶基因分析
9. 差异miRNA 靶基因GO 注释和KEGG 通路分析

交付标准
数据：6-10M raw reads
分析：标准分析报告
时间：40个工作日

应用方向
生长发育调控研究、抗病抗逆调控研究、生物性状及突变调控研究、寻找生物标记、靶向药物研究等。

样品要求
核酸样本：
total RNA≥1ug，浓度≥20ng/μL，体积≥50ul，无 DNA，蛋白/盐离子等污染，样本无色透明不粘稠
组织样本：
新鲜动物组织干重≥200mg，脂肪、皮肤、骨头、血管等组织 ≥ 500mg
全血样本：
总量≥2 mL 全血收集的淋巴细胞或≥2 mL全血（Paxgene Blood RNA tube / RNAprotect ®  Animal Blood Tubes）

特殊说明
无