病原与宿主互作

产品介绍
原核链异性转录组测序（Bulk RNA-seq）是针对有参考基因组的原核生物，通过高通量测序平台对特定细胞在某一功能状态下产生的RNA进行高通量测序，经过与参考基因组比对，快速检测基因表达量、基因结构及功能注释信息，了解不同表型下基因表达的差异转态。
这里的原核生物主要指细菌。

技术流程
总RNA提取---->rRNA去除---->反转合成cDNA---->链特异性文库构建---->上机测序---->生信分析

分析内容
标准信息分析： 
1. 测序数据质量评估
2. 基因表达水平分析
3. 样本相关性分析
4. 差异基因分析
5. 差异基因的GO，KEGG富集分析
6. 基因集富集（GSEA）分析
7. 蛋白互作网络分析
8. WGCNA基因共表达网络分析

交付标准
数据：RAW DATA 2G
分析：标准分析报告
周期：30个工作日

应用方向
原核转录组已经广泛应用于微生物的生物学功能、胁迫环境下微生物的机体响应机制和差异性状研究等。

样品要求
1.送样量：
●菌体：细胞>1*107个或>0.5g
●滤膜≥5张，分开冻存后寄送。
● 总RNA：总量：≥ 1μg，浓度：≥ 50ng/μL，体积：20μL ≤ V ≤ 120μL。 
2.采集建议
● 收集对数生长期的菌体
● 不建议用RNAlater保存
● 不加TRIzol，影响菌体裂解

特殊说明
原核转录组只做有参考基因组的样本，无参考基因组的样本可先测基因组，组装完成图再做转录组。