病原与宿主互作

产品介绍
真核转录组（有参）测序（Bulk RNA-seq）是针对有参考基因组的物种，通过高通量测序平台对特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，经过与参考基因组比对，快速检测基因表达量、基因结构及功能注释信息，了解不同表型下基因表达的差异转态，以及可变剪接和新转录本情况。

技术流程
总RNA提取---->mRNA富集---->反转合成cDNA---->文库构建---->上机测序---->生信分析

分析内容
标准信息分析：
1. 基本数据统计
 去除接头序列、低质量序列得到reads信息
2. 参考基因组比对；
3. 基因鉴定；
4. 基因定量分析；
5. 基因差异表达分析（样本间、组间）；
6. 基因表达/差异基因聚类；
7. 基因差异基因GO分类、富集；
8. 基因差异基因KEGG分类、富集；
9. 可变剪切分析；

交付标准
数据：RAW DATA 6G
分析：标准分析报告
周期：20个工作日

应用方向
成熟产品已经广泛应用于动植物发育调控、胁迫研究、遗传进化、发病机制研究等。
 

样品要求
核酸样本：
≥400ng，浓度≥10ng/μL，体积≥20ul，无 DNA，蛋白/盐离子等污染，样本无色透明不粘稠
组织样本：
新鲜动物组织干重≥50mg，脂肪、皮肤、骨头、血管等组织 ≥ 300mg
全血样本：
总量≥1 mL 全血收集的淋巴细胞或≥1 mL全血（Paxgene Blood RNA tube / RNAprotect ®  Animal Blood Tubes）