特色病毒组

产品简介
靶向病毒组 (target virome) 测序分析是指通过设计合成靶向多种病毒的探针，杂交捕获富集病毒序列，然后进行高通量测序，通过生物信息分析快速鉴定样本中的病毒组成情况，可用于常见病原的捕获测序，如呼吸道感染病毒检测。

技术路线
病毒PANEL设计合成---样本前处理---核酸提取---文库构建---靶向捕获富集---高通量测序---生物信息分析

分析内容
【基础版】
（1）基础数据处理
1. 数据质控
2. 去除低质量及接头序列
3. 去除宿主及污染序列
4. 比对定制真核病毒库，计算reads捕获比率
（2）病毒序列鉴定
5. 单样本序列组装
6. 多样本序列聚类
7. 基于reads的病毒鉴定 (Kraken2分析)
8. 基于contigs的病毒鉴定及注释

【标准版】
（3）病毒组成及群落
9. 病毒定量及丰度统计
10. 病毒不同分类组成
11. 病毒群落的α,β多样性（需分组，每组>10个样本）
12. 特有及共有病毒
（4）组间比较分析
13. LefSe差异分析 （需分组，每组>10个样本）
14. MaAslin2差异分析 （需分组，每组>30个样本）
15. DESeq2差异分析 （需分组，每组>10个样本）
16. 疾病建模/marker筛选（项目样本数目>100个）

【定制版】
（5）个性化分析
17. 根据研究需要定制分析内容

说明：不同交付标准，提供的分析内容不同。

应用方向
病毒多样性：通过靶向病毒组测序研究人体病毒的多样性、病毒变异以及组成情况。
病毒与疾病的关系：通过靶向病毒组测序探索病毒与人类和动物疾病的关系，为疾病预防提供方向。
病毒溯源：通过靶向病毒组测序对目标传染病病原传播途径的进行详细调研，探索病毒来源及变异方向。
临床感染诊断：可应用于呼吸道病毒感染、血流病毒感染、中枢神经系统病毒感染等临床病原检测，辅助临床医生根据检测结果为患者制定精准的诊疗方案。
人畜共患病毒的研究：通过靶向病毒组测序对人畜共患的病毒进行分析，提前对致病病原体开展筛查，预防大规模传染病的发生。

交付标准
数据：2-5G raw data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准。分别为标准版和定制版。
周期：标准版40个工作日，其它标准根据样本情况确定。

样品要求
1.粪便：样本量不低于200mg，尽量提供600mg（2ml冻存管半管左右），可分两管保存，小鼠粪便不低于5颗，大鼠样品不低于2颗；
2.鼻咽拭子：拭子1-2支；
3.人或动物组织：样本量不低于200 mg。
……
详细要求，请参考《基因帮样本采集建议》（点击查看）