特色病毒组
病毒组(virome)又称为宏病毒组或者病毒宏基因组，指栖居于特定生物体或特定环境中所有病毒的基因组。病毒分布于水体、冰川、土壤、动植物、微生物甚至某些病毒当中，按核酸类型可以分为DNA病毒和RNA病毒，按宿主可分为真核病毒和原核病毒。病毒在维持环境内稳态、生态系统平衡等方面起着非常重要的作用，并且与人类的健康等密切相关。
DNA病毒组测序分析
简介
DNA病毒组测序分析是指通过实验技术手段对各类型样本（如粪便、唾液、动物组织、植物叶片、土壤和水体等）中的病毒颗粒进行富集，然后提取病毒基因组DNA进行高通量建库及测序，通过生物信息分析确定样本中各类型病毒的序列、丰度等信息，进而深入分析样本中病毒的多样性、致病性、鉴定新的DNA病毒以及发现与某些性状、功能或者疾病等相关的病毒等等。
DNA病毒以脱氧核糖核酸（DNA）为遗传物质，广泛存在于人、脊椎动物、昆虫体内以及多种传代细胞系中，分为单链DNA病毒、双链DNA病毒。噬菌体是一类以细菌为宿主的病毒，在自然界中种类极其丰富，大部分噬菌体均为DNA病毒。
常见的DNA病毒有：噬菌体、乙肝病毒HBV、疱疹病毒等。
技术路线
样本前处理---病毒颗粒富集---病毒DNA提取---DNA文库构建----高通量测序---生物信息分析
分析内容
【基础版】
（1）基础数据处理
1. 数据质控
2. 去除低质量及接头序列
3. 去除宿主及污染序列
（2）病毒序列鉴定
4. 单样本序列组装
5. 多样本序列聚类
6. 基于reads的病毒鉴定 (Kraken2分析)
7. 基于contigs的病毒鉴定及注释
（3）病毒组成及群落
8. 病毒定量及丰度统计
9. 不同分类水平的病毒组成
10. 病毒群落的α,β多样性分析（样本需分组，每组>10个样本）
11. 特有及共有病毒
（4）组间比较分析
12. LefSe差异分析 （需分组，每组>10个样本）
13. DESeq2差异分析 （需分组，每组>10个样本）
【标准版】
14. MaAslin2差异分析 （需分组，每组>30个样本）
15. 疾病建模/marker筛选（项目样本数目>100个）
（5）噬菌体与细菌互作分析
16. 噬菌体-宿主预测
17. 噬菌体-宿主相关性
18. 噬菌体-宿主互作网络
19. 宿主功能富集分析
（6）病毒功能分析
20. 病毒显著差异功能的筛选（需分组，每组>10个样本）
【定制版】
（7）定制化分析
21. 根据研究需要定制分析内容
说明：不同交付标准，提供的分析内容不同。
应用方向
DNA病毒多样性及新病毒发现：通过DNA病毒组学技术对环境或动植物及人体中的DNA病毒群落的组成结构进行分析，并且发现新的病毒。
病毒与人类的关系：通过DNA病毒组学技术探索DNA病毒与人类共生共存的机制，以及对人类健康的影响。
噬菌体与耐药菌治疗：通过DNA病毒组学技术发现更多裂解性噬菌体，用于抗生素耐药细菌的治疗，造福人类。
病毒与肿瘤的关系：通过DNA病毒组学技术探索病毒与肿瘤发生、发展与治疗的关系，为肿瘤的预防、诊断和治疗提供更多思路。
交付标准
数据：10G raw data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准。分别为基础版、标准版和专业版。
周期：基础版 30个工作日，标准版40个工作日，专业版根据样本情况确定。
产品与服务
