病毒/微生物基因组

产品简介
病毒基因组测序分析（Virus WGS）是指针对分离纯化后的单一病毒提取基因组，并根据病毒基因组的核酸类型（DNA或RNA）和单双链特点，采用不同的建库方案构建小片段文库，进行高通量测序，然后利用生物信息学方法进行组装、基因预测和功能注释，从而获得单病毒的全基因组序列图谱，对于多株病毒后续可进行多态性或者进化方面的分析。

技术路线
 

分析内容
【基础版】

 (1) 数据质控
1.数据质控
2.去除低质量及接头序列
3.去除宿主及杂质序列
 (2) 基因组组装
4.多软件组装及评估
5.组装结果优化及补洞
 (3) 基因组注释
6.ORF预测及基因注释
7.基因组圈图绘制
8.毒力基因分析

【标准版】
9.进化分析（系统发育树）

【定制版】
10.与近缘病毒的比较基因组分析
11. 根据研究需求定制分析内容

应用方向
新病毒基因组组装：用二代测序直接组装出完整病毒基因组，助力病毒研究。
病毒变异分析：用病毒基因组测序分析，发现病毒序列变异过程。

交付标准
数据：1G raw data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准，分别为标准版和定制版。
周期：标准版 30个工作日，其它标准根据样本情况确定。

样品要求
核酸样本：要求无其它基因组污染，并且明确核酸类型：ssRNA、dsRNA、ssDNA、dsDNA。
浓度要求：5 ng/μL，20 μL以上。
病毒样本：病毒滴度不低于10⁶/mL，样本量不低于1 mL。
三代测序：核酸总量≥2 μg，浓度≥50 ng/μL。