病原微生物鉴定

产品简介
病原微生物全谱测序鉴定是指对感染标本中的微生物群落提取总核酸，对DNA和RNA进行共建库及高通量测序，通过生物信息分析确定样本中各类型病原微生物的序列、丰度和物种注释等信息，同时可以预测未知病毒。为感染性疾病提供快速精准诊断依据，显著提高病原诊断阳性率。
基因帮采用全病毒组建库和宏基因组建库，可全面检测真核病毒和细菌、真菌和支原体。针对感染丰度较高的病毒，可以直接进行全长组装，方便后续研究。

技术路线
样本前处理---病毒颗粒富集---病毒总核酸提取---（RNA反转+DNA）文库构建---高通量测序---生物信息分析
样本处理---基因组DNA提取---文库构建---高通量测序---生物信息分析

分析内容
基础数据分析
1. 数据质控
2. 去除低质量及接头序列
3. 去除宿主及污染序列
序列组装
4. reads拼接组装
病原鉴定
5. 比对到病原数据库
真菌统计及定量
细菌统计及定量
病毒统计及定量
寄生虫统计及定量
6. 新病毒预测

应用方向
已知病原发现
新病毒预测

交付标准
数据：6-10G raw data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准，分别为标准版和定制版。
周期：标准版40个工作日，其它标准根据样本情况确定。

样品要求
详细要求，请参考《基因帮样本采集建议》