三代微生物组
三代微生物组测序分析是指针对特定样品（如粪便、唾液、土壤、水体等）中的微生物群落（含病毒颗粒），提取总基因组 DNA 或富集病毒核酸后，利用 Pacbio/cyclone 高通量测序平台进行超长读长测序，再通过生物信息学方法进行基因组组装，进而分析微生物（含病毒）的序列、丰度、多样性、致病性等信息，以实现微生物群落注释鉴定、新病毒发现等目标的技术体系。该技术通过超长读长优势克服了二代测序读长较短的缺陷，有效提高了基因组组装准确性及微生物群落分析的精准度。
三代病毒组测序分析
产品简介
三代病毒组测序分析是指通过实验技术手段对各类型样本（如粪便、唾液、土壤和水体等）中的病毒颗粒进行富集，然后提取病毒核酸进行Pacbio/cyclone三代高通量测序，通过生物信息组装病毒基因组，分析病毒序列、丰度等信息，进而深入分析样本中病毒的多样性、致病性以及发现新的病毒等。
三代测序对样品量需求量比二代测序高，制备难度大，基因帮提供两个不同的实验方案：
MDA扩增方案：适用样品量比较低的样品（如肠内容物、唾液、呼吸道样品等）；
非扩增方案：适用于样品量足够的样品（土壤样品、粪便样品）。
技术路线
MDA扩增方案：样本前处理---病毒颗粒富集---病毒核酸提取---MDA扩增---文库构建---Pacbio/cyclone测序---生物信息分析
非扩增方案：样本前处理---病毒颗粒富集---病毒核酸提取---文库构建---Pacbio/cyclone测序---生物信息分析
分析内容
1.三代测序数据矫正
2.三代reads的宿主序列去除
3.三代序列组装
4.所有组装序列整合，冗余去除及质量评估
5.病毒序列的鉴定及注释
6.病毒vOTU水平丰度计算、不同分类水平相对丰度计算
7.各分类水平病毒组成分析
8.基于vOTU(或物种)水平的α、β多样性分析
9.不同分类水平的差异病毒筛选
10.所有病毒的基因功能分析（基于COG及kegg）
11. 根据研究需要定制分析内容
说明：不同交付标准，提供的分析内容不同。
应用方向
完整病毒基因组捕获：三代病毒组和二代病毒组测序数据结合组装，大大提升了从样本中回收完整病毒基因组，发现更多新病毒，丰富对新病毒的认识和了解。
新病毒发现：三代病毒组测序的高灵敏度能够检测到低丰度的病毒，对于发现新病毒种类非常有用。
交付标准
数据：10G Raw Data
分析：我们根据客户的需求提供不同的交付标准，分别为标准版和定制版。
周期：标准版 60个工作日，其它标准根据样本情况确定。
样品要求
详细要求，请参考《基因帮样本采集建议》
产品与服务
